Instituten opzoeken | Vlaams Instituut voor de Zee
 

Vlaams Instituut voor de Zee

Platform voor marien onderzoek

Instituten opzoeken

[ meld een fout in dit record ] Print deze pagina

Bioinformatics and (eco-)systems biology lab (KULeuven)
http://www.raeslab.org/
http://www.vib.be/en/research/scientists/Pages/Jeroen-Raes-Lab.aspx
Het Raes lab combineert grootschalige next-generation sequencing met nieuwe computationele benaderingen om het functioneren en de variabiliteit van microbiële gemeenschappen te onderzoeken. Daarnaast richt het lab zich op het ontwikkelen van computationele methodes voor de analyse van (next-generation) sequence data en het onderzoek van eigenschappen van gemeenschappen aan de hand van metagenomica, transcriptoomstudie en meta-metabolomics data, die vervolgens toegepast worden in verschillende omgevingen (oceanen, bodem, etc.).

Het marien onderzoek van het lab richt zich op vergelijkende metagenomica en de transcriptoomstudie van oceanische planktongemeenschappen gaande van virussen tot larven van vissen. Dit onderzoek maakt eveneens deel uit van het Laboratorium voor Bioinformatica en Ecosysteembiologie van het VIB.

Nederlandse naam: Laboratorium voor Bioinformatica en Ecosysteembiology
Overkoepelend instituut: KU Leuven; Rega-instituut; Department of Microbiology and Immunology (KULeuven), meer

Adres:
Herestraat 49
box 1028
B-3000 Leuven
België
 
Type: Wetenschappelijk
    ( 2 peer reviewed ) opsplitsen filter
  • Peer reviewed article Carradec, Q.; Pelletier, E.; Da Silva, C.; Alberti, A.; Seeleuthner, Y.; Blanc-Mathieu, R.; Lima-Mendez, G.; Rocha, F.; Tirichine, L.; Labadie, K.; Kirilovsky, A.; Bertrand, A.; Engelen, S.; Madoui, M.-A.; Méheust, R.; Poulain, J.; Romac, S.; Richter, D.J.; Yoshikawa, G.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Searson, S.; Tara Oceans Coordinators; Jaillon, O.; Aury, J.-M.; Karsenti, E.; Sullivan, M.B.; Sunagawa, S.; Bork, P.; Not, F.; Hingamp, P.; Raes, J.; Guidi, L.; Ogata, H.; de Vargas, C.; Iudicone, D.; Bowler, C.; Wincker, P. (2018). A global ocean atlas of eukaryotic genes. Nature Comm. 9(1): 13 pp. https://hdl.handle.net/10.1038/s41467-017-02342-1, meer
  • Peer reviewed article Guidi, L.; Chaffron, S.; Bittner, L.; Eveillard, D.; Larhlimi, A.; Roux, S.; Darzi, Y.; Audic, S.; Berline, L.; Brum, J.R.; Coelho, L.P.; Ignacio-Espinoza, J.C.; Malviya, S.; Sunagawa, S.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Poulain, J.; Searson, S.; Tara Oceans Consortium Coordinators; Stemmann, L.; Not, F.; Hingamp, P.; Speich, S.; Follows, M.; Karp-Boss, L.; Boss, E.S.; Ogata, H.; Pesant, S.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Acinas, S.G.; Bork, P.; de Vargas, C.; Iudicone, D.; Sullivan, M.B.; Raes, J.; Karsenti, E.; Bowler, C.; Gorsky, G. (2016). Plankton networks driving carbon export in the oligotrophic ocean. Nature (Lond.) 532(7600): 465-470. hdl.handle.net/10.1038/nature16942, meer