Zooscan | Vlaams Instituut voor de Zee
 

Vlaams Instituut voor de Zee

Platform voor marien onderzoek

Zooscan

De zooSCAN is een toestel dat gebruikt wordt om (1) digitale beelden te maken van zoöplanktonmonsters, (2) op een snelle en halfautomatische wijze zoöplanktonmonsters te verwerken en te analyseren en (3) om data van snel degenererende geleiachtig plankton te verzamelen. Doordat zoöplankton aan de basis staat van de voedselketen en de samenstelling van zoöplanktonsoorten soms gebruikt wordt om de ecologie van het water in te schatten, biedt de zooSCAN vooral een groot voordeel in het analyseren van grote monstersets. 

Hoe werkt een zooscan?

De zooscan gebruikt een scanner technologie met aangepaste verlichting en een waterdichte scankamer waarin vloeibare zoöplanktonmonsters kunnen gebracht worden. De scanner maakt een digitaal, hoge-resolutie  beeld. Het vloeibaar monster kan terug gerecupereerd worden, zonder het te vernielen, via een afvoerkanaal. Met een resolutie van ongeveer 10,6 µm kan de zooSCAN gebruikt worden voor objecten groter dan 200 µm en is hij dus optimaal voor het in beeld brengen van zoöplankton. De digitale beelden worden geanalyseerd door de computer; alle organismen/deeltjes van de monsters worden toegekend aan verscheidene taxonomische groepen (bijvoorbeeld Appendicularia, Calanoida, Gammaridae, etc.). Er kan ook een onderscheid gemaakt worden tussen organismen en debris, zandkorrels of plastiek. Deze identificatie is gebaseerd op een semi-automatische vergelijking van elk organisme/deeltje uit het gescande beeld met een bibliotheek van organismen. Een dergelijke bibliotheek kan gemaakt worden voor elk individueel onderzoek maar kan ook geïmporteerd worden uit een vorig onderzoek. Hoewel het algoritme zorgt voor een hoog herkenningsniveau van de organismen, blijft het toch aangeraden om een complementaire manuele vergelijking uit te voeren. 

  Foto's

Waarom de zooscan gebruiken?

  • Dankzij de zooscan verkrijgt men gedetailleerde meta-data voor elk gescand beeld.
  • De mogelijkheid bestaat om de resultaten (groepen en aantallen) grafisch uit te zetten. Hierdoor kunnen ze snel vergeleken worden met resultaten van andere/vorige onderzoeken.
  • Hoewel de resolutie van de digitale zoöplankton beelden lager is dan beelden verkregen met een binoculair, is de zooscan techniek zeer geschikt voor het analyseren van grote monstersets.
  • Dankzij het eenvoudig gebruik van de zooscan kunnen zowel studenten als wetenschappers en technische staf dit toestel gebruiken
  • Digitale beelden van zoöplanktonmonsters op snelle en halfautomatische wijze verkregen en geanalyseerd

Enkele studies:

  • Identificeren en monitoren van zoöplankton in het Belgische deel van de Noordzee:

Dit wordt uitgevoerd door LifeWatch (coördinatie van VLIZ en het Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO)).

  • Zoöplankton en diens rol in Noordzee voedselwebben:

Van Ginderdeuren, K. (2013)

Technische details

Het VLIZ stelt een zooscan ter beschikking die de volgende technische eigenschappen heeft:

  • Dimensies:


© hydroptic.com

  • Gewicht: 25 Kg
  • Interface: USB 2.0
  • Bestand tegen zoutwater, formaldehyde en ethanol
  • Monstervolume: 0,2 tot 1 liter
  • Beeldresolutie: tot 4800 dpi
  • Elk beeld van een organisme/partikel kan verwerkt worden tot één afzonderlijk beeld van 24,5 cm x 15,8 cm
  • Aanpasbaar lichtsysteem om de beeldkwaliteit en contrast te verbeteren
  • Klik hier voor meer technische details

Gebruik maken van de zooSCAN?

Gelieve het VLIZ te contacteren voor meer informatie over onze uitleendienst.

Gebruik en voorwaarden

Opgelet! Indien u als wetenschapper gebruik maakt van de zooSCAN die door het VLIZ ter beschikking gesteld wordt, gelieve daar dan als volgt aan te refereren in uw publicaties: "This work was supported by data & infrastructure provided by VLIZ as part of the Flemish contribution to LifeWatch."