 Latka, A.; Aertsen, A.; Boeckaerts, D.; Blasdel, B.; Ceyssens, P.-J.; Garcia-Pino, A.; Gillis, A.; Lavigne, R.; Lima-Mendez, G.; Matthijnssens, J.; Onsea, J.; Peeters, E.; Pirnay, J.-P.; Thiry, D.; Vandenheuvel, D.; Van Mechelen, E.; Venneman, J.; Verbeken, G.; Wagemans, J.; Briers, Y. (2023). Foundation of the Belgian Society for Viruses of Microbes and meeting report of its inaugural symposium. Viruses 15(5): 1213. https://dx.doi.org/10.3390/v15051213, more- Acinas, S.G.; Sánchez, P.; Salazar, G.; Cornejo-Castillo, F.M.; Sebastian, M.; Logares, R.; Royo-Llonch, M.; Paoli, L.; Sunagawa, S.; Hingamp, P.; Ogata, H.; Lima-Mendez, G.; Roux, S.; González, J.M.; Arrieta, J.M.; Alam, I.S.; Kamau, A.; Bowler, C.; Raes, J.; Pesant, S.; Bork, P.; Agusti, S.; Gojobori, T.; Vaqué, D.; Sullivan, M.B.; Pedrós-Alió, C.; Massana, R.; Duarte, C.M.; Gasol, J.M. (2021). Deep ocean metagenomes provide insight into the metabolic architecture of bathypelagic microbial communities. Communications Biology 4(1): 604. https://dx.doi.org/10.1038/s42003-021-02112-2, more
- Deutschmann, I.M.; Lima-Mendez, G.; Krabberod, A.K.; Raes, J.; Vallina, S.M.; Faust, K.; Logares, R. (2021). Disentangling environmental effects in microbial association networks. Microbiome 9(1): 232. https://dx.doi.org/10.1186/s40168-021-01141-7, more
- Deutschmann, I.M.; Lima-Mendez, G.; Krabberod, A.K.; Raes, J.; Vallina, S.M.; Faust, K.; Logares, R. (2021). Correction to: Disentangling environmental effects in microbial association networks. Microbiome 9(1): 245. https://dx.doi.org/10.1186/s40168-021-01209-4, more
- Caputi, L.; Carradec, Q.; Eveillard, D.; Kirilovsky, A.; Pelletier, E.; Pierella Karlusich, J.J.; Vieira, F.R.J.; Villar, E.; Chaffron, S.; Malviya, S.; Scalco, E.; Acinas, S.G.; Alberti, A.; Aury, J.-M.; Benoiston, A.-S.; Bertrand, A.; Biard, T.; Bittner, L.; Boccara, M.; Brum, J.R.; Brunet, C.; Busseni, G.; Carratalà, A.; Claustre, H.; Coelho, L.P.; Colin, S.; D’Aniello, S.; Da Silva, C.; Del Core, M.; Doré, H.; Gasparini, S.; Kokoszka, F.; Jamet, J.-L.; Lejeusne, C.; Lepoivre, C.; Lescot, M.; Lima-Mendez, G.; Lombard, F.; Lukeš, J.; Maillet, N.; Madoui, M.-A.; Martinez, E.; Mazzocchi, M.G.; Néou, M.B.; Paz-Yepes, J.; Poulain, J.; Ramondenc, S.; Romagnan, J.-B.; Roux, S.; Salvagio Manta, D.; Sanges, R.; Speich, S.; Sprovieri, M.; Sunagawa, S.; Taillandier, V.; Tanaka, A.; Tirichine, L.; Trottier, C.; Uitz, J.; Veluchamy, A.; Veselá, J.; Vincent, F.; Yau, S.; Kandels-Lewis, S.; Searson, S.; Dimier, C.; Picheral, M.; Tara Oceans Coordinators; Bork, P.; Boss, E.; de Vargas, C.; Follows, M.J.; Grimsley, N.; Guidi, L.; Hingamp, P.; Karsenti, E.; Sordino, P.; Stemmann, L.; Sullivan, M.B.; Tagliabue, A.; Zingone, A.; Garczarek, L.; D’Ortenzio, F.; Testor, P.; Not, F.; d'Alcalà, M.R.; Wincker, P.; Bowler, C.; Iudicone, D. (2019). Community-level responses to iron availability in open ocean plankton ecosystems. Global Biogeochem. Cycles 33(3): 391-419. https://dx.doi.org/10.1029/2018GB006022, more
- Carradec, Q.; Pelletier, E.; Da Silva, C.; Alberti, A.; Seeleuthner, Y.; Blanc-Mathieu, R.; Lima-Mendez, G.; Rocha, F.; Tirichine, L.; Labadie, K.; Kirilovsky, A.; Bertrand, A.; Engelen, S.; Madoui, M.-A.; Méheust, R.; Poulain, J.; Romac, S.; Richter, D.J.; Yoshikawa, G.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Searson, S.; Tara Oceans Coordinators; Jaillon, O.; Aury, J.-M.; Karsenti, E.; Sullivan, M.B.; Sunagawa, S.; Bork, P.; Not, F.; Hingamp, P.; Raes, J.; Guidi, L.; Ogata, H.; de Vargas, C.; Iudicone, D.; Bowler, C.; Wincker, P. (2018). A global ocean atlas of eukaryotic genes. Nature Comm. 9(1): 13 pp. https://dx.doi.org/10.1038/s41467-017-02342-1, more
- Cornejo-Castillo, F.M.; Cabello, A.M.; Salazar, G.; Sánchez-Baracaldo, P.; Lima-Mendez, G.; Hingamp, P.; Alberti, A.; Sunagawa, S.; Bork, P.; de Vargas, C.; Raes, J.; Bowler, C.; Wincker, P.; Zehr, J.P.; Gasol, J.M.; Massana, R.; Acinas, S.G. (2016). Cyanobacterial symbionts diverged in the late Cretaceous towards lineage-specific nitrogen fixation factories in single-celled phytoplankton. Nature Comm. 7(11071). http://dx.doi.org/10.1038/ncomms11071, more
- de Vargas, C.; Audic, S.; Henry, N.; Decelle, J.; Mahé, F.; Logares, R.; Lara, E.; Berney, C.; Le Bescot, N.; Probert, I.; Carmichael, M.; Poulain, J.; Romac, S.; Colin, S.; Aury, J.-M.; Bittner, L.; Chaffron, S.; Dunthorn, M.; Engelen, S.; Flegontova, O.; Guidi, L.; Horák, A.; Jaillon, O.; Lima-Mendez, G.; Lukeš, J.; Malviya, S.; Morard, R.; Mulot, M.; Scalco, E.; Siano, R.; Vincent, F.; Zingone, A.; Dimier, C.; Picheral, M.; Searson, S.; Kandels-Lewis, S.; Acinas, S.G.; Bork, P.; Bowler, C.; Gorsky, G.; Grimsley, N.; Hingamp, P.; Iudicone, D.; Not, F.; Ogata, H.; Pesant, S.; Raes, J.; Sieracki, M.E.; Speich, S.; Stemmann, L.; Sunagawa, S.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Karsenti, E. (2015). Eukaryotic plankton diversity in the sunlit ocean. Science (Wash.) 348(6237): 11 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1261605, more
- Lima-Mendez, G.; Faust, K.; Henry, N.; Decelle, J.; Colin, S.; Carcillo, F.; Chaffron, S.; Ignacio-Espinoza, J.C.; Roux, S.; Vincent, F.; Bittner, L.; Darzi, Y.; Wang, J.; Audic, S.; Berline, L.; Bontempi, G.; Cabello, A.M.; Coppola, L.; Cornejo-Castillo, F.M.; De Meester, L.; Ferrera, I.; Garet-Delmas, M.-J.; Guidi, L.; Lara, E.; Pesant, S.; Royo-Llonch, M.; Salazar, G.; Sánchez, P.; Sebastian, M.; Souffreau, C.; Dimier, C.; Picheral, M.; Searson, S.; Kandels-Lewis, S.; Gorsky, G.; Not, F.; Ogata, H.; Speich, S.; Stemmann, L.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Acinas, S.G.; Sunagawa, S.; Bork, P.; Sullivan, M.B.; Karsenti, E.; Bowler, C.; de Vargas, C.; Raes, J. (2015). Determinants of community structure in the global plankton interactome. Science (Wash.) 348(6237): 9 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1262073, more
- Sunagawa, S.; Coelho, L.P.; Chaffron, S.; Kultima, J.R.; Labadie, K.; Salazar, G.; Djahanschiri, B.; Zeller, G.; Mende, D.R.; Alberti, A.; Cornejo-Castillo, F.M.; Costea, P.I.; Cruaud, C.; d'Ovidio, F.; Engelen, S.; Ferrera, I.; Gasol, J.M.; Guidi, L.; Hildebrand, F.; Kokoszka, F.; Lepoivre, C.; Lima-Mendez, G.; Poulain, J.; Poulos, B.T.; Royo-Llonch, M.; Sarmento, H.; Vieira-Silva, S.; Dimier, C.; Picheral, M.; Searson, S.; Kandels-Lewis, S.; Bowler, C.; de Vargas, C.; Gorsky, G.; Grimsley, N.; Hingamp, P.; Iudicone, D.; Jaillon, O.; Not, F.; Ogata, H.; Pesant, S.; Speich, S.; Stemmann, L.; Suillivan, M.B.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Karsenti, E.; Raes, J.; Acinas, S.G.; Bork, P. (2015). Structure and function of the global ocean microbiome. Science (Wash.) 348(6237): 9 pp. http://dx.doi.org/10.1126/science.1261359, more
- Logares, R.; Sunagawa, S.; Salazar, G.; Cornejo-Castillo, F.; Ferrera, I.; Sarmento, H.; Hingamp, P.; Ogata, H.; de Vargas, C.; Lima-Mendez, G.; Raes, J.; Poulain, J.; Jaillon, O.; Wincker, P.; Kandels-Lewis, S.; Karsenti, E.; Bork, P.; Acinas, S. (2014). Metagenomic 16S rDNA Illumina tags are a powerful alternative to amplicon sequencing to explore diversity and structure of microbial communities. Environ. Microbiol. 16(9): 2659-2671. https://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.12250, more
- Hingamp, P.; Grimsley, N.; Acinas, S.G.; Clerissi, C.; Subirana, L.; Poulain, J.; Ferrera, I.; Sarmento, H.; Villar, E.; Lima-Mendez, G.; Faust, K.; Sunagawa, S.; Claverie, J.-M.; Moreau, H.; Desdevises, Y.; Bork, P.; Raes, J.; de Vargas, C.; Karsenti, E.; Kandels-Lewis, S.; Jaillon, O.; Not, F.; Pesant, S.; Wincker, P.; Ogata, H. (2013). Exploring nucleo-cytoplasmic large DNA viruses in Tara Oceans microbial metagenomes. ISME J. 7(9): 1678-1695. https://dx.doi.org/10.1038/ismej.2013.59, more
|
